Komputery

W Centrum Nowych Technologii UW powstanie superkomputer Orion

opublikowano przez Paweł Maziarz w dniu 2015-07-03

Badania bioinformatyczne realizowanych w CSNG wymagają dużej mocy obliczeniowej, którą zapewni klaster obliczeniowy Orion.

GSI klaster obliczeniowy L-CSC

W Centrum Sekwencjonowania Nowej Generacji (CSNG), które jest częścią Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego, powstanie klaster obliczeniowy Orion – będzie on wspierał m.in. badania bioinformatyczne związane z sekwencjonowaniem nowej generacji (NGS).

Klaster Orion składa się ze 150 serwerów Dell PowerEdge R730, z których każdy został wyposażony w dwie karty graficzne AMD FirePro S9150, co przekłada się na 1,52 PFLOPSa mocy w obliczeniach pojedynczej precyzji i 0,76 PFLOPSa w obliczeniach podwójnej precyzji. Superkomputer umożliwia przeprowadzanie bardzo szybkich obliczeń stosowanych w badaniach genomicznych i bioinformatycznych, które dzięki wykorzystaniu implementacji OpenCL mogą być realizowane w niezwykle wydajny sposób.

CSNG w Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego to centrum badawcze prowadzące najbardziej zaawansowane badania genomiczne i bioinformatyczne w biologii, medycynie, diagnostyce i terapii. Klaster Orion został zaprojektowany i zbudowany w celu przechowywania i analizy olbrzymich ilości danych generowanych przez sekwenatory funkcjonujące w Centrum. CSNG zarówno samodzielnie, jak i we współpracy z innymi ośrodkami realizuje szereg projektów z zakresu genomiki, udostępniając nowoczesną technologię sekwencjonowania środowisku naukowemu oraz branży przemysłowej. Naukowcy z całego świata wykorzystują CSNG do przeprowadzania badań w obszarze genomiki, metagenomiki, epigenetyki i transkryptomiki, co umożliwia im dokonywanie fascynujących odkryć naukowych. Wiele badań bioinformatycznych realizowanych w CSNG wymaga dużej mocy obliczeniowej, którą teraz zapewnia klaster Orion.

AMD FirePro S9150 karta graficzna
W klastrze obliczeniowym Orion znajdzie się aż 300 kart graficznych AMD FirePro S9150

"Współpraca z Dell i AMD była niezwykle udana biorąc pod uwagę, że projekt ten realizowany był w tak krótkim czasie" — powiedział dr Krzysztof Ginalski, kierownik Centrum Sekwencjonowania Nowej Generacji oraz Laboratorium Bioinformatyki i Biologii Systemów w Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego. — "Nowoczesna technologia i wiodące w branży możliwości zarządzania systemami, jakie zapewniają serwery Dell PowerEdge R730 wyposażone w karty graficzne AMD FirePro S9150, sprawiają, że klaster Orion to potężna jednostka oferująca moc, jakiej potrzebujemy do naszych badań. Duża 16-gigabajtowa pojemność pamięci kart graficznych AMD FirePro S9150 umożliwia nam tworzenie oprogramowania wykorzystywanego do zaawansowanych obliczeń bioinformatycznych uruchamianych na pojedynczych akceleratorach GPU. Wybraliśmy system z wieloma kartami GPU aby móc stworzyć efektywną energetycznie i kosztowo konfigurację."

Źródło: AMD

marketplace

Komentarze

23
Zaloguj się, żeby skomentować
avatar
Dodaj
Komentowanie dostępne jest tylko dla zarejestrowanych użytkowników serwisu.
  • avatar
    Cieszy mnie bardzo, że Uniwersytet Warszawski podjął dobrą decyzję i wybrał AMD FirePro S9150, które są w tym momencie najlepszym rozwiązaniem dla superkomputerów, które mają być możliwie jak najbardziej energooszczędne (najefektywniejszy superkomputer na green500 w GSI Helmholtz Center używa właśnie tych kart).
    Szkoda tylko, że nie zdecydowali się na więcej szaf do klastra. Oczywiście można jeszcze rozszerzyć, tylko że już chyba kartami na 14nm. Polska nauka jest wciąż zbyt mało konkurencyjna, więc takie postępy są naszemu krajowi potrzebne.
  • avatar
    Może Batman w 30 fps'ach i 720p na ultra ruszy.
    Zaloguj się
  • avatar
    http://www.benchmark.pl/aktualnosci/zobacz-jak-powstaje-najwiekszy-polski-superkomputer-cis.html
    Nauczyli się wreszcie openCL.
    Zaloguj się
  • avatar
    Ciekawym jest to, że matka natura jak ją nazywamy tworzy organizmy o stopniu komplikacji jaki zabija nasze najnowsze superkomputery.

    Wszystko to co żyje sprawia wrażenie softu, generatora ( dna jako kod źródłowy ) który klepie kopie jak leci według wzorca jednak z lekką dowolnością formy. Coś jak random levele w Diablo :P

    Jakimś cudem ten organizm potrafi to wszystko wykonać i wykreować siebie w gotowej postaci.

    Czy jest to zatem dzieło doskonałego architekta dysponującego sprzętem z mocą obliczeniową znacznie ponad nasze obecne możliwości czy też coś zupełnie innego?

    :P
    Zaloguj się
  • avatar
    ciekawe jak majnkraft na tym pójdzie
    Zaloguj się
    -8
  • avatar
    Podawanie mocy obliczeniowej pojedynczej precyzji przy superkomputerach, jest śmieszne.
    Zaloguj się
  • avatar
    Ciekawe jak na tym chodziłby crysis...